基因降維（(dimension reduction)至數個基因通路

目的：將一萬多個基因降維（(dimension reduction)至數個基因通路差異

圖一：

鰻魚以雄性素處理，同一隻魚的卵細胞卵徑發育情形 （以機率分佈表示；我們認為0.1 mm 是一個敏感性分界，野生的銀鰻卵徑在0.3 mm以上) ，2613 與 1440 最終卵徑統計上是沒顯著差異的，但在卵徑分佈上是有差異的 （拖尾或凸肩）（上圖左邊），這情形符合基因表的差異熱圖（基因數目＝12135個）上圖右邊）。

圖二：

根據熱圖，採取簇集(clustering)分析，將表現程度不同的基因分群，將同群基因以KEGG為本進行基因通路富集分析(gene set pathway enrichment analysis)，再將各隻鰻魚所得的富集結果畫出文氏圖 （Venn diagrams），以交集情形推測造成外表型(phenotype)差異的基因基礎與基因背景。本圖為上調的基因通路。

下一步：了解同一基因路徑中各個基因的功能比重。